Class-switch Recombination Interplay Of Transcription Dna Deamination And Dna Repair Pdf

File Name: class-switch recombination interplay of transcription dna deamination and dna repair .zip
Size: 12126Kb
Published: 14.05.2021

The mechanisms by which B cells somatically engineer their genomes to generate the vast diversity of antibodies required to challenge the nearly infinite number of antigens that immune systems encounter are of tremendous clinical and academic interest. Recent discoveries indicate a significant promiscuous targeting of this B-cell mutator enzyme genome-wide. Here we discuss the various regulatory elements that control AID activity and prevent AID from inducing genomic instability and thereby initiating oncogenesis.

The B cell thereby changes from expressing IgM to one producing IgG, IgE, or IgA, with each antibody isotype having a different effector function during an immune reaction. CSR is a multistep reaction requiring transcription through S regions, the DNA cytidine deaminase AID, and the participation of several general DNA repair pathways including base excision repair, mismatch repair, and classical nonhomologous end-joining. In this review, we discuss our current understanding of how transcription through S regions generates substrates for AID-mediated deamination and how AID participates not only in the initiation of CSR but also in the conversion of deaminated residues into DSBs.

Regulation of AID, the B-cell genome mutator

Since then, tremendous progress has been achieved toward elucidating how AID functions. AID targets the highly repetitive switch regions of the immunoglobulin heavy chain IgH locus to induce DNA double-strand breaks DSBs , which can be rejoined, leading to switch of constant regions of antibody. This review focuses on the mechanisms that provide the specificity of AID targeting to Ig loci and the role of AID in genomic instability. This is a preview of subscription content, access via your institution. Rent this article via DeepDyve.

DNA lesions inflicted by activation-induced deaminase AID instrumentally initiate the processes reshaping immunoglobulin genes in mature B-cells, from local somatic hypermutation SHM to junctions of distant breaks during class switch recombination CSR. Class switching allows B lymphocytes to replace expression of immunoglobin M with that of immunoglobulins G, A or E. The genetic support of class switching, is a unique and large deletion uniquely occuring within the immunoglobulin heavy chain IgH locus. In immunoglobulin light chain loci, AID only stimulates somatic hypermutation. This study identifies the minimal elements necessary for class-switch recombination to occur instead of hypermutation in a locus targeted by AID, i. PLoS Genet 17 2 : e

Erratum: Class-switch recombination: interplay of transcription, DNA deamination and DNA repair

Thank you for visiting nature. You are using a browser version with limited support for CSS. To obtain the best experience, we recommend you use a more up to date browser or turn off compatibility mode in Internet Explorer. In the meantime, to ensure continued support, we are displaying the site without styles and JavaScript. This results in the generation of antibodies of secondary isotypes IgG, IgA or IgE , which have different effector functions.

Either your web browser doesn't support Javascript or it is currently turned off. In the latter case, please turn on Javascript support in your web browser and reload this page. Nature reviews. Immunology , 25 Jun , 12 7 : DOI: Review Free to read. CSR entails changes of the chromatin state and transcriptional activation of the IgH locus upstream and downstream switch S regions that are to undergo S-S DNA recombination, induction of AID, and targeting of CSR factors to S regions by adaptors and as enabled by the transcription machinery and histone modifications.


Class-switch recombination: interplay of transcription, DNA deamination and DNA repair. Jayanta Chaudhuri &; Frederick W. Alt.


Class-switch recombination: interplay of transcription, DNA deamination and DNA repair

Thank you for visiting nature. You are using a browser version with limited support for CSS. To obtain the best experience, we recommend you use a more up to date browser or turn off compatibility mode in Internet Explorer. In the meantime, to ensure continued support, we are displaying the site without styles and JavaScript. The Original Article was published on 01 November

Given that AID can instigate DNA lesions and genomic instability, stringent checks are imposed that constrain and restrict its mutagenic potential. In this review, we will discuss how AID expression and substrate specificity and activity is rigorously enforced at the transcriptional, post-transcriptional, post-translational, and epigenetic levels, and how the DNA-damage response is choreographed with precision to permit targeted activity while limiting bystander catastrophe. B cells are specialized lymphocytes that express Ig receptors or antibodies on their cell surface. A salient feature of B-lymphocytes is their ability to recognize an almost infinite array of antigens. This enormous diversity is achieved through V D J recombination, a process that assembles the exons encoding the amino-terminal variable regions of IgH and IgL from component variable V , diversity D , and joining J segments 1.

J Exp Med 11 May ; 5 : — Class switch recombination CSR allows the humoral immune response to exploit different effector pathways through specific secondary antibody isotypes. However, the molecular mechanisms and factors that control immunoglobulin Ig isotype choice for CSR are unclear. Thus, our results reveal transcriptional competition between constant region genes in individual cells to be a critical and general mechanism for isotype specification during CSR. We show that Ikaros is a master regulator of this competition.

The role of activation-induced deaminase in antibody diversification and genomic instability

Adaptive immune responses require the generation of a diverse repertoire of immunoglobulins Igs that can recognize and neutralize a seemingly infinite number of antigens. Within the Ig locus, DNA repair pathways are diverted from their canonical role in maintaining genomic integrity to permit AID-directed mutation and deletion of gene coding segments. Recently identified proteins, genes, and regulatory networks have provided new insights into the temporally and spatially coordinated molecular interactions that control the formation and repair of DSBs within the Ig locus. Unravelling the genetic program that allows B cells to selectively alter the Ig coding regions while protecting non-Ig genes from DNA damage advances our understanding of the molecular processes that maintain genomic integrity as well as humoral immunity. Mammalian adaptive immune responses require B cells to produce immunoglobulins Igs , commonly known as antibodies, that can recognize a seemingly infinite number of antigens on foreign pathogens.

 Мне поручено передать вам.  - Он протянул конверт Беккеру, и тот прочитал надпись, сделанную синими чернилами: Сдачу возьмите. Беккер открыл конверт и увидел толстую пачку красноватых банкнот. - Что. - Местная валюта, - безучастно сказал пилот.

Immunoglobulin class-switch DNA recombination: induction, targeting and beyond.

The adaptive immune system

Стратмор рассмеялся: - Несколько миллионов. Ты понимаешь, сколько стоит эта штука. Любое правительство выложит любые деньги. Можешь ли ты представить себе, как мы будем докладываем президенту, что перехватили сообщения иракцев, но не в состоянии их прочитать. И дело тут не только в АНБ, речь идет обо всем разведывательном сообществе. Наша машина обеспечивает информацией ФБР, ЦРУ, Агентство по борьбе с наркотиками - всем им теперь придется действовать вслепую. Не удастся отслеживать перемещение грузов наркокартелей, крупные корпорации смогут переводить деньги, не оставляя никакого следа и держа Налоговое управление в полном неведении, террористы будут в полной тайне готовить свои акции.

 Джабба - дурак! - прошипела. Эти слова его удивили. Никто никогда не называл Джаббу дураком, свиньей - быть может, но дураком -. - Свою женскую интуицию ты ставишь выше ученых степеней и опыта Джаббы в области антивирусного программирования. Она взглянула на него с холодным презрением. Бринкерхофф поднял руки в знак капитуляции. - Извини.

Последняя защитная стенка на центральном экране почти совсем исчезла. Черные линии, сбившись в кучу вокруг ядра, настолько сгустились, что их масса стала совсем непрозрачной и легонько подрагивала. Мидж отвернулась. Фонтейн стоял очень прямо, глядя прямо перед. У Бринкерхоффа был такой вид, словно он вот-вот лишится чувств. - Десять секунд. Глаза Сьюзан неотрывно смотрели на Танкадо.

Применив силу, говорил этот голос, ты столкнешься с сопротивлением. Но заставь противника думать так, как выгодно тебе, и у тебя вместо врага появится союзник. - Сьюзан, - услышал он собственный голос, - Стратмор - убийца. Ты в опасности.

Боюсь, что в ТРАНСТЕКСТЕ завелся какой-то неизвестный вирус. - Вирус? - снисходительно хмыкнул Стратмор, - Фил, я высоко ценю твою бдительность, очень высоко. Но мы с мисс Флетчер проводим диагностику особого рода. Это файл высочайшей сложности.

Он тихо выругался. Тогда почему они послали не профессионального агента, а университетского преподавателя. Выйдя из зоны видимости бармена, Беккер вылил остатки напитка в цветочный горшок. От водки у него появилось легкое головокружение. Сьюзан, подшучивая над ним, часто говорила, что напоить его не составляет никакого труда.

За секунду до смерти Танкадо успел отдать его какому-то туристу. - Это возмутительно! - взорвался Нуматака.  - Каким же образом вы выполните обещание об эксклюзивном… - Не волнуйтесь, - спокойно ответил американец.  - Эксклюзивные права у вас. Это я гарантирую.

 О чем. - Квадрат Цезаря, - просияла Сьюзан.  - Читается сверху. Танкадо прислал нам письмо.

Конечно, чтобы придать своему плану правдоподобность, Танкадо использовал тайный адрес… тайный ровно в той мере, чтобы никто не заподозрил обмана. Он сам был своим партнером. Никакой Северной Дакоты нет и в помине.

Ikaros controls isotype selection during immunoglobulin class switch recombination

Рафаэль де ла Маза, банкир из пригорода Севильи, скончался почти мгновенно. Рука его все еще сжимала пачку банкнот, пятьдесят тысяч песет, которые какой-то сумасшедший американец заплатил ему за дешевый черный пиджак. ГЛАВА 94 Мидж Милкен в крайнем раздражении стояла возле бачка с охлажденной водой у входа в комнату заседаний. Что, черт возьми, делает Фонтейн? - Смяв в кулаке бумажный стаканчик, она с силой швырнула его в бачок для мусора.  - В шифровалке творится нечто непонятное.

ГЛАВА 42 Вернувшись в комнату, Сьюзан, не находя себе места, нервно ходила из угла в угол, терзаясь мыслью о том, что так и не выбрала момент, чтобы разоблачить Хейла. А тот спокойно сидел за своим терминалом. - Стресс - это убийца, Сью. Что тебя тревожит. Сьюзан заставила себя сесть.

Как это удобно. Вспомнив всю услышанную от шефа ложь, она похолодела и посмотрела на него, в глазах ее мелькнуло подозрение. - Это вы убили Танкадо. Стратмор вздрогнул и замотал головой: - Конечно.

Согласно информации, появившейся в окне, команда была подана менее двадцати минут .